MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 9886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011989	TGT	2	6	1116641	1116646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_011989	CAG	2	6	1116701	1116706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_011989	CAC	2	6	1116793	1116798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_011989	TCT	2	6	1116799	1116804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_011989	A	8	8	1116879	1116886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_011989	GGA	2	6	1117066	1117071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_011989	CGG	2	6	1117657	1117662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_011989	GGC	2	6	1117685	1117690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_011989	GCT	3	9	1119237	1119245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_011989	TTG	2	6	1119308	1119313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_011989	T	6	6	1119433	1119438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_011989	CGC	2	6	1119450	1119455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_011989	TGC	2	6	1120254	1120259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_011989	CTT	2	6	1120269	1120274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_011989	CCG	2	6	1120279	1120284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_011989	TC	3	6	1120354	1120359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_011989	AGG	2	6	1121671	1121676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011989	GC	3	6	1121718	1121723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_011989	GCG	2	6	1121761	1121766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_011989	GGAT	2	8	1122749	1122756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011989	C	6	6	1124057	1124062	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3022	NC_011989	GCA	2	6	1125056	1125061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_011989	GCTGC	2	10	1125084	1125093	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3024	NC_011989	GCC	2	6	1125111	1125116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_011989	GGC	2	6	1125122	1125127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_011989	GCGA	2	8	1125144	1125151	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_011989	GCAA	2	8	1126820	1126827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_011989	GCA	2	6	1126911	1126916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_011989	TC	3	6	1127024	1127029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_011989	CG	3	6	1127069	1127074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_011989	GA	3	6	1127078	1127083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_011989	GGC	2	6	1127127	1127132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_011989	T	6	6	1127166	1127171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_011989	GCC	2	6	1128030	1128035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_011989	GGC	2	6	1130755	1130760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_011989	CGCTC	2	10	1130768	1130777	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3037	NC_011989	GGC	3	9	1130790	1130798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_011989	GCA	2	6	1130877	1130882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_011989	AAT	2	6	1135007	1135012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_011989	CATT	2	8	1135084	1135091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_011989	T	6	6	1135575	1135580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3043	NC_011989	GGC	2	6	1137876	1137881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_011989	CAT	2	6	1138405	1138410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_011989	GTT	2	6	1138463	1138468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011989	TCA	2	6	1138476	1138481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_011989	TCCG	2	8	1138567	1138574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_011989	A	6	6	1138586	1138591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_011989	GGC	2	6	1142689	1142694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3052	NC_011989	ACG	2	6	1142875	1142880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_011989	GGC	2	6	1142980	1142985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_011989	GTC	2	6	1143070	1143075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_011989	ATCC	2	8	1143181	1143188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_011989	ACGAT	2	10	1143237	1143246	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3057	NC_011989	GGCA	2	8	1143321	1143328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_011989	GGC	2	6	1143342	1143347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_011989	GGC	3	9	1144841	1144849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3061	NC_011989	GC	3	6	1152547	1152552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_011989	CGCT	2	8	1152553	1152560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_011989	ATC	2	6	1152579	1152584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_011989	TTC	2	6	1152590	1152595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3078	NC_011989	T	6	6	1157122	1157127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_011989	CAA	2	6	1157159	1157164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3081	NC_011989	GTC	2	6	1157286	1157291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3087	NC_011989	ATTG	2	8	1160047	1160054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3095	NC_011989	GCGG	2	8	1161233	1161240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3096	NC_011989	CG	3	6	1161253	1161258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_011989	CCG	2	6	1161268	1161273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3100	NC_011989	AT	3	6	1161594	1161599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_011989	ATG	2	6	1161634	1161639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3103	NC_011989	TG	3	6	1161702	1161707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_011989	GCT	3	9	1163969	1163977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_011989	GC	3	6	1164021	1164026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_011989	TGA	2	6	1164063	1164068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_011989	GC	3	6	1164120	1164125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_011989	ATT	2	6	1168899	1168904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_011989	TAA	2	6	1168979	1168984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_011989	TTCG	2	8	1169008	1169015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_011989	CGG	2	6	1169026	1169031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_011989	CA	3	6	1169939	1169944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_011989	CAG	2	6	1170009	1170014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_011989	TTTGA	2	10	1170060	1170069	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3117	NC_011989	GCG	2	6	1171891	1171896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_011989	GCG	2	6	1171964	1171969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_011989	GCG	2	6	1172037	1172042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_011989	GGT	2	6	1172080	1172085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3122	NC_011989	GTTG	2	8	1172115	1172122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_011989	GAG	2	6	1172231	1172236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_011989	TTTTC	2	10	1173409	1173418	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3125	NC_011989	A	6	6	1173456	1173461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_011989	CAAGC	2	10	1173552	1173561	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3127	NC_011989	TCGT	2	8	1173583	1173590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_011989	TGA	2	6	1175221	1175226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_011989	GTCA	2	8	1175265	1175272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3130	NC_011989	CGA	2	6	1176466	1176471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3132	NC_011989	ACTC	2	8	1176491	1176498	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_011989	CCG	2	6	1177907	1177912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3134	NC_011989	ACCG	2	8	1177920	1177927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3136	NC_011989	CTGC	2	8	1178065	1178072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3145	NC_011989	GTCG	2	8	1178356	1178363	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3164	NC_011989	CG	3	6	1184661	1184666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3165	NC_011989	TTG	2	6	1186286	1186291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3170	NC_011989	TGG	2	6	1186482	1186487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3262	NC_011989	CAA	2	6	1213995	1214000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3264	NC_011989	CAT	2	6	1214670	1214675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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